Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GP1BBP13224 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms