Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms