Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RARBP10826 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RARBP10826 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RARBP10826 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RARBP10826 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms