Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI3P10071 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI3P10071 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
GLI3P10071 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GLI3P10071 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GLI3P10071 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms