Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RGPD2P0DJD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms