Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RGPD1P0DJD0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms