Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PKHD1P08F94 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
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