Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP3A4P08684 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms