Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLEC3BP05452 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLEC3BP05452 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms