Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX58O95786 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX58O95786 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms