Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRPM2O94759 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms