Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms