Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms