Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms