Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPIPA5E9PKD4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms