Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-2B6SEH9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms