Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WWV3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WWV3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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