Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
CNTN3Q9P232 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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