Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FAM20AQ96MK3 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FAM20AQ96MK3 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.6 ms