Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC109635.1-201ENST00000529200 490 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02396-203ENST00000551922 525 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL132777.1-201ENST00000556153 618 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC138907.7-202ENST00000565347 540 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC007614.1-201ENST00000566607 309 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC141257.2-201ENST00000569199 540 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF415-223ENST00000601215 561 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC079230.1-201ENST00000602428 1143 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CARMN-212ENST00000614896 536 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC245041.1-201ENST00000619523 826 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00506-204ENST00000630120 587 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KNOP1P5-201ENST00000358374 1378 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTFR1-201ENST00000262146 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SUGT1P3-201ENST00000304932 1051 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HPN-AS1-201ENST00000392227 1124 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC073316.1-205ENST00000404626 557 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ANXA2P3-201ENST00000404883 1008 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FAM192BP-201ENST00000414628 762 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-IT1-201ENST00000423329 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 Z68871.1-201ENST00000426528 1133 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL358976.1-201ENST00000437555 392 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL008627.1-201ENST00000446953 486 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms