Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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