Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SNW1Q13573 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms