Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
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NEUROD1Q13562 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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NEUROD1Q13562 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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NEUROD1Q13562 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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NEUROD1Q13562 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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