Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
EIF4EBP1Q13541 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms