Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PICALMQ13492 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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