Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms