Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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