Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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