Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RPS29P62273 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms