Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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HOXD12P35452 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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HOXD12P35452 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HOXD12P35452 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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