Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM21P19474 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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