Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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CLDN9O95484 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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CLDN9O95484 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLDN9O95484 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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