Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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