Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SH3BP4Q9P0V3 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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