Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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TMOD4Q9NZQ9 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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TMOD4Q9NZQ9 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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TMOD4Q9NZQ9 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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TMOD4Q9NZQ9 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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TMOD4Q9NZQ9 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
TMOD4Q9NZQ9 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMOD4Q9NZQ9 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMOD4Q9NZQ9 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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