Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms