Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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