Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PIK3C2B-202ENST00000367187 7686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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