Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CHD4Q14839 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHD4Q14839 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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