Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SMCO1Q147U7 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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SMCO1Q147U7 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMCO1Q147U7 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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