Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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ATP1A4Q13733 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ATP1A4Q13733 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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