Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TCOF1Q13428 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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TCOF1Q13428 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TCOF1Q13428 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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