Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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ITGB3BPQ13352 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ITGB3BPQ13352 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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