Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
IFT88Q13099 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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