Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF2Q12947 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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