Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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