Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHRNEQ04844 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms