Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
E2F1Q01094 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms