Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PSMB5P28074 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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