Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTPRCP08575 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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